Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl1Q99J56 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms