Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms