Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms