Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms