Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms