Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms