Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms