Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Trappc12Q8K2L8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Trappc12Q8K2L8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trappc12Q8K2L8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trappc12Q8K2L8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trappc12Q8K2L8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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