Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Csnka2ipQ8CH19 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Csnka2ipQ8CH19 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Csnka2ipQ8CH19 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Csnka2ipQ8CH19 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Csnka2ipQ8CH19 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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