Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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