Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms