Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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