Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms