Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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