Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms