Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms