Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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