Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms