Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb40Q6PCS8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb40Q6PCS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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