Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms