Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms