Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms