Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms