Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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