Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Znf608Q56A10 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf608Q56A10 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms