Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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R3hdm4Q4VBF2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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R3hdm4Q4VBF2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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R3hdm4Q4VBF2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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R3hdm4Q4VBF2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm4Q4VBF2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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