Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms