Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9Q3V038 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ttc9Q3V038 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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