Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3UPC7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms