Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms