Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx27Q3UHD6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx27Q3UHD6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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