Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Atxn7l3bQ3UD01 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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