Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ctdnep1Q3TP92 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ctdnep1Q3TP92 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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