Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms