Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne7Q0VE82 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms