Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rab42Q0PD08 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms