Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms