Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cntn3Q07409 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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