Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms