Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CkbQ04447 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CkbQ04447 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CkbQ04447 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CkbQ04447 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms