Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl7Q03366 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms