Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms