Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms