Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb2Q00977 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms