Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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