Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms