Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H3f3aP84244 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms