Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nucb2P81117 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms