Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad50P70388 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms