Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms